Phylogenetische Analysen und Bayesianische Statistik

 

 

 

 

Mr.Bayes

Kurzbeschreibung :

Mr.Bayes(J.P.Huelsenbeck & F.Ronquist ,2003) ist ein hilfreiches Werkzeug zur phylogenetischen Analyse verschiedener Datentypen(z.B.morphologisch oder genetisch).Es basiert auf dem nach dem Mathematiker Thomas Bayes benannten Bayes-Theorem .Dieses tool beinhaltet unterschiedliche Modelle zur Sequenzevolution und ist in verschiedenen Versionen für unterschiedliche Systemoberflächen verfügbar.Das Programm arbeitet mit einem MCMC-Algorithmus, welcher Stichproben aus Wahrscheinlichkeitsverteilungen zieht.Die Befehlseingabe erfolgt über ein Command line interface.Als Eingabedatei verwendet Mr.Bayes das gängige NEXUS-Format.

 

Nützliche Links zum Thema Mr.Bayes :

1.Mr.Bayes Handbuch

2.Original Veröffentlichung von Huelsenbeck & Ronquist

Abb.1 : Command line interface von Mr.Bayes